杂志名称:ScientificReports
文章题目:OsteoarthritisoftheTemporomandibularJointcanbediagnosedearlierusingbiomarkersandmachinelearning
第一作者:JonasBianchi
通讯作者:JonasBianchi
单位:密歇根大学,圣保罗州立大学
本实验所用产品:定制人类定量抗体芯片
实验样品类型:唾液和血清
研究摘要
Abstract
骨关节炎(OA)影响全球数百万人,导致他们多年疼痛和残疾。随着年龄的增长,颞下颌关节骨关节炎(TMJ-OA)会引起慢性残疾。颞下颌关节是研究OA早期骨变化的独特模型,因为关节骨表面仅被颞下颌关节髁中的一层薄薄的纤维软骨覆盖。TMJ-OA是一种多系统性疾病,涉及众多病理生理过程,需要全面评估进行性软骨退化、软骨下骨重塑和慢性疼痛的特征。
研究者希望在OA患者骨形态退化发生之前进行诊断并干预。于是建立了4个模型LogisticRegression,RandomForest,LightGBM,XGBoost,综合评估了52个临床、生物学和高分辨率CBCT(影像组学)标志物。建模的特征包括:是否头痛,张口无疼痛范围,Haralick相关性,熵和TGF-β1在唾液中的相互作用,血清中的VE-钙粘蛋白和唾液中的血管生成素等。结果表明,具有这些特征和交互作用的XGBoost+LightGBM模型在诊断TMJ-OA状态时准确率达到了0.,AUC0.和F1得分0.。因此,研究团队希望促进未来对骨关节炎患者特定治疗干预的研究,从而改善关节的健康。
研究结果Part.
1
基于网络的平台,用于存储和计算临床、影像组学和生物分子标记的数据分析
用DataStorageforComputationandIntegration(DSCI)存储和集成来自多个来源的患者信息进行数据管理。DCSI通过DataBaselnteractor插件与3DSlicer平台通信,允许用户上传临床,成像和生物标志物。
Part.
2
对照组和TMJ-OA患者组的放射学特征、生物学特征和影像学特征研究
放射学特征主要集中在下颌髁小梁骨的初始形态变化(Table2);生物学特征与颞下颌关节滑膜中检测到的VE-cad,ANG,TGF-β1和PAI-1与OA患者的髁突形态相关(RayBio定制抗体芯片,Figure2);影像学特征与疼痛相关或受疼痛限制相关(Table3)。
Part.
3
用上述特征进行TMJ-OA的特征选择和模型构建
评估了52个特征。大多数有效AUC值的是临床或影像组学的特征(AUC0.65);生物学特征差异不显著,然而,临床或影像组学的特征与生物学特征的相互作用可以达到0.74的AUC(图3C),并且对TMJ-OA的预测有很大的贡献。Part.
4
主要特征和交互特征诊断TMJ-OA
蛋白与临床和影像组学特征的相互作用在诊断中十分重要,带有交互特征的XGBoost+LightGBM模型是最优的,可实现准确率0.、AUC0.和F1得分0.的最佳表现。研究结论
Conclusion
总之,深入统计学习分析是基于52个单独特征和多个交互特征综合分析。研究人员筛选了每个特征的诊断性能(图3-5),并根据最相关的蛋白、临床、影像学特征构建了机器学习模型。研究人员的最终预测模型使用LightGBM+XGBoost预测TMJ-OA状态的准确率为0.(SD:0.),具有个特征交互作用。重要的是,研究团队展示了新工具、数据采集、管理和方法的全面整合,以改善关节健康并预测患者特定的TMJ-OA状态。
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